Avidemux офегенная программа для склейки flv без перекодировки, естественно если видео и звук кодированы одинаково, может из контейра flv достать звук и видео и в секунды засунуть в avi контейнер, т.е. несравнимо лучше чем пользоваться конвертором

http://avidemux.sourceforge.net/